Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTJ4

Uncharacterized protein C8orf48 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 293 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TTJ4 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q3TTJ4 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q3TTJ4 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q3TTJ4 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q3TTJ4 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q3TTJ4 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q3TTJ4 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q3TTJ4 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q3TTJ4 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q3TTJ4 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q3TTJ4 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q3TTJ4 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q3TTJ4 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Q3TTJ4 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q3TTJ4 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q3TTJ4 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q3TTJ4 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q3TTJ4 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q3TTJ4 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q3TTJ4 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q3TTJ4 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q3TTJ4 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Q3TTJ4 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q3TTJ4 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q3TTJ4 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q3TTJ4 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q3TTJ4 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q3TTJ4 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q3TTJ4 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q3TTJ4 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q3TTJ4 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q3TTJ4 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q3TTJ4 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q3TTJ4 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q3TTJ4 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q3TTJ4 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q3TTJ4 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q3TTJ4 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Q3TTJ4 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q3TTJ4 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q3TTJ4 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q3TTJ4 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q3TTJ4 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q3TTJ4 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q3TTJ4 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q3TTJ4 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q3TTJ4 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q3TTJ4 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q3TTJ4 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q3TTJ4 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q3TTJ4 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q3TTJ4 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q3TTJ4 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q3TTJ4 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q3TTJ4 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q3TTJ4 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Q3TTJ4 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Q3TTJ4 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q3TTJ4 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q3TTJ4 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q3TTJ4 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q3TTJ4 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Q3TTJ4 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Q3TTJ4 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q3TTJ4 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q3TTJ4 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Q3TTJ4 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Q3TTJ4 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Q3TTJ4 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Q3TTJ4 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Q3TTJ4 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q3TTJ4 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Q3TTJ4 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q3TTJ4 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q3TTJ4 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Q3TTJ4 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Q3TTJ4 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q3TTJ4 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q3TTJ4 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q3TTJ4 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Q3TTJ4 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Q3TTJ4 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q3TTJ4 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q3TTJ4 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q3TTJ4 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Q3TTJ4 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Q3TTJ4 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q3TTJ4 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q3TTJ4 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q3TTJ4 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q3TTJ4 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q3TTJ4 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q3TTJ4 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q3TTJ4 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q3TTJ4 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q3TTJ4 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Q3TTJ4 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q3TTJ4 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q3TTJ4 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Q3TTJ4 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms