Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctdnep1Q3TP92 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctdnep1Q3TP92 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctdnep1Q3TP92 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctdnep1Q3TP92 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctdnep1Q3TP92 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctdnep1Q3TP92 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctdnep1Q3TP92 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctdnep1Q3TP92 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctdnep1Q3TP92 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctdnep1Q3TP92 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctdnep1Q3TP92 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctdnep1Q3TP92 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctdnep1Q3TP92 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctdnep1Q3TP92 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctdnep1Q3TP92 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctdnep1Q3TP92 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctdnep1Q3TP92 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctdnep1Q3TP92 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctdnep1Q3TP92 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctdnep1Q3TP92 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctdnep1Q3TP92 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctdnep1Q3TP92 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctdnep1Q3TP92 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctdnep1Q3TP92 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctdnep1Q3TP92 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctdnep1Q3TP92 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctdnep1Q3TP92 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctdnep1Q3TP92 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctdnep1Q3TP92 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctdnep1Q3TP92 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctdnep1Q3TP92 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctdnep1Q3TP92 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctdnep1Q3TP92 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctdnep1Q3TP92 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctdnep1Q3TP92 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctdnep1Q3TP92 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctdnep1Q3TP92 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctdnep1Q3TP92 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctdnep1Q3TP92 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctdnep1Q3TP92 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctdnep1Q3TP92 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctdnep1Q3TP92 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctdnep1Q3TP92 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctdnep1Q3TP92 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctdnep1Q3TP92 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctdnep1Q3TP92 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctdnep1Q3TP92 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctdnep1Q3TP92 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctdnep1Q3TP92 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctdnep1Q3TP92 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctdnep1Q3TP92 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctdnep1Q3TP92 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctdnep1Q3TP92 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctdnep1Q3TP92 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctdnep1Q3TP92 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctdnep1Q3TP92 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctdnep1Q3TP92 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctdnep1Q3TP92 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctdnep1Q3TP92 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctdnep1Q3TP92 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctdnep1Q3TP92 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctdnep1Q3TP92 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Ctdnep1Q3TP92 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Ctdnep1Q3TP92 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Ctdnep1Q3TP92 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctdnep1Q3TP92 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctdnep1Q3TP92 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctdnep1Q3TP92 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctdnep1Q3TP92 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctdnep1Q3TP92 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctdnep1Q3TP92 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctdnep1Q3TP92 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctdnep1Q3TP92 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctdnep1Q3TP92 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctdnep1Q3TP92 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctdnep1Q3TP92 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctdnep1Q3TP92 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctdnep1Q3TP92 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctdnep1Q3TP92 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctdnep1Q3TP92 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctdnep1Q3TP92 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctdnep1Q3TP92 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctdnep1Q3TP92 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctdnep1Q3TP92 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctdnep1Q3TP92 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctdnep1Q3TP92 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctdnep1Q3TP92 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctdnep1Q3TP92 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctdnep1Q3TP92 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctdnep1Q3TP92 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctdnep1Q3TP92 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
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