Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc13Q3TIR1 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc13Q3TIR1 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc13Q3TIR1 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc13Q3TIR1 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc13Q3TIR1 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc13Q3TIR1 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc13Q3TIR1 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc13Q3TIR1 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc13Q3TIR1 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc13Q3TIR1 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc13Q3TIR1 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc13Q3TIR1 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc13Q3TIR1 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc13Q3TIR1 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc13Q3TIR1 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc13Q3TIR1 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc13Q3TIR1 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc13Q3TIR1 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc13Q3TIR1 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc13Q3TIR1 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc13Q3TIR1 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc13Q3TIR1 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc13Q3TIR1 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc13Q3TIR1 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc13Q3TIR1 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc13Q3TIR1 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc13Q3TIR1 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc13Q3TIR1 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc13Q3TIR1 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc13Q3TIR1 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc13Q3TIR1 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc13Q3TIR1 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc13Q3TIR1 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc13Q3TIR1 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc13Q3TIR1 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc13Q3TIR1 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc13Q3TIR1 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc13Q3TIR1 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc13Q3TIR1 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc13Q3TIR1 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc13Q3TIR1 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trappc13Q3TIR1 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trappc13Q3TIR1 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trappc13Q3TIR1 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trappc13Q3TIR1 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trappc13Q3TIR1 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trappc13Q3TIR1 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trappc13Q3TIR1 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trappc13Q3TIR1 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trappc13Q3TIR1 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trappc13Q3TIR1 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trappc13Q3TIR1 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trappc13Q3TIR1 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trappc13Q3TIR1 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trappc13Q3TIR1 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trappc13Q3TIR1 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trappc13Q3TIR1 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trappc13Q3TIR1 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trappc13Q3TIR1 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trappc13Q3TIR1 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trappc13Q3TIR1 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Trappc13Q3TIR1 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trappc13Q3TIR1 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Trappc13Q3TIR1 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trappc13Q3TIR1 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Trappc13Q3TIR1 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trappc13Q3TIR1 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trappc13Q3TIR1 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trappc13Q3TIR1 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Trappc13Q3TIR1 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trappc13Q3TIR1 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trappc13Q3TIR1 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trappc13Q3TIR1 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trappc13Q3TIR1 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trappc13Q3TIR1 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trappc13Q3TIR1 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trappc13Q3TIR1 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Trappc13Q3TIR1 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trappc13Q3TIR1 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc13Q3TIR1 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc13Q3TIR1 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc13Q3TIR1 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc13Q3TIR1 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc13Q3TIR1 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc13Q3TIR1 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc13Q3TIR1 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc13Q3TIR1 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc13Q3TIR1 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc13Q3TIR1 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc13Q3TIR1 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc13Q3TIR1 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc13Q3TIR1 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc13Q3TIR1 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc13Q3TIR1 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc13Q3TIR1 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc13Q3TIR1 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc13Q3TIR1 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc13Q3TIR1 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc13Q3TIR1 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61 ms