Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
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ptchd1Q14B62 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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ptchd1Q14B62 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
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ptchd1Q14B62 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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