Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
TrioQ0KL02 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
TrioQ0KL02 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
TrioQ0KL02 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
TrioQ0KL02 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
TrioQ0KL02 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
TrioQ0KL02 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
TrioQ0KL02 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
TrioQ0KL02 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
TrioQ0KL02 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
TrioQ0KL02 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
TrioQ0KL02 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
TrioQ0KL02 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
TrioQ0KL02 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
TrioQ0KL02 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
TrioQ0KL02 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
TrioQ0KL02 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
TrioQ0KL02 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
TrioQ0KL02 Srp19-201ENSMUST00000072576 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
TrioQ0KL02 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
TrioQ0KL02 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
TrioQ0KL02 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
TrioQ0KL02 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
TrioQ0KL02 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
TrioQ0KL02 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
TrioQ0KL02 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
TrioQ0KL02 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
TrioQ0KL02 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
TrioQ0KL02 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
TrioQ0KL02 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
TrioQ0KL02 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
TrioQ0KL02 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
TrioQ0KL02 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
TrioQ0KL02 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
TrioQ0KL02 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
TrioQ0KL02 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
TrioQ0KL02 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
TrioQ0KL02 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
TrioQ0KL02 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
TrioQ0KL02 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
TrioQ0KL02 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
TrioQ0KL02 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
TrioQ0KL02 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
TrioQ0KL02 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
TrioQ0KL02 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
TrioQ0KL02 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
TrioQ0KL02 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
TrioQ0KL02 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
TrioQ0KL02 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
TrioQ0KL02 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
TrioQ0KL02 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
TrioQ0KL02 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
TrioQ0KL02 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
TrioQ0KL02 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
TrioQ0KL02 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
TrioQ0KL02 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
TrioQ0KL02 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
TrioQ0KL02 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
TrioQ0KL02 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
TrioQ0KL02 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
TrioQ0KL02 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
TrioQ0KL02 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
TrioQ0KL02 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
TrioQ0KL02 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
TrioQ0KL02 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
TrioQ0KL02 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
TrioQ0KL02 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
TrioQ0KL02 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
TrioQ0KL02 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
TrioQ0KL02 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
TrioQ0KL02 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
TrioQ0KL02 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
TrioQ0KL02 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
TrioQ0KL02 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
TrioQ0KL02 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
TrioQ0KL02 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
TrioQ0KL02 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
TrioQ0KL02 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
TrioQ0KL02 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
TrioQ0KL02 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
TrioQ0KL02 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
TrioQ0KL02 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
TrioQ0KL02 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
TrioQ0KL02 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
TrioQ0KL02 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
TrioQ0KL02 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
TrioQ0KL02 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
TrioQ0KL02 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
TrioQ0KL02 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
TrioQ0KL02 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
TrioQ0KL02 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
TrioQ0KL02 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
TrioQ0KL02 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
TrioQ0KL02 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
TrioQ0KL02 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
TrioQ0KL02 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
TrioQ0KL02 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
TrioQ0KL02 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
TrioQ0KL02 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
TrioQ0KL02 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms