Protein–RNA interactions for Protein: Q08624

Hoxc4, Homeobox protein Hox-C4, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc4Q08624 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Hoxc4Q08624 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
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