Protein–RNA interactions for Protein: Q03347

Runx1, Runt-related transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Runx1Q03347 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Runx1Q03347 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Runx1Q03347 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Runx1Q03347 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Runx1Q03347 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Runx1Q03347 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Runx1Q03347 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Runx1Q03347 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Runx1Q03347 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Runx1Q03347 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Runx1Q03347 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Runx1Q03347 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Runx1Q03347 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Runx1Q03347 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Runx1Q03347 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Runx1Q03347 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Runx1Q03347 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Runx1Q03347 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Runx1Q03347 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Runx1Q03347 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Runx1Q03347 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Runx1Q03347 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Runx1Q03347 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Runx1Q03347 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Runx1Q03347 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Runx1Q03347 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Runx1Q03347 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Runx1Q03347 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Runx1Q03347 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Runx1Q03347 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Runx1Q03347 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Runx1Q03347 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Runx1Q03347 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Runx1Q03347 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Runx1Q03347 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Runx1Q03347 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Runx1Q03347 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Runx1Q03347 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Runx1Q03347 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Runx1Q03347 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Runx1Q03347 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Runx1Q03347 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Runx1Q03347 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Runx1Q03347 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Runx1Q03347 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Runx1Q03347 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Runx1Q03347 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Runx1Q03347 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Runx1Q03347 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Runx1Q03347 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Runx1Q03347 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Runx1Q03347 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Runx1Q03347 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Runx1Q03347 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Runx1Q03347 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Runx1Q03347 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Runx1Q03347 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Runx1Q03347 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Runx1Q03347 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Runx1Q03347 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Runx1Q03347 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Runx1Q03347 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Runx1Q03347 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Runx1Q03347 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Runx1Q03347 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Runx1Q03347 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Runx1Q03347 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Runx1Q03347 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Runx1Q03347 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Runx1Q03347 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Runx1Q03347 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Runx1Q03347 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Runx1Q03347 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Runx1Q03347 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Runx1Q03347 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Runx1Q03347 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Runx1Q03347 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Runx1Q03347 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Runx1Q03347 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Runx1Q03347 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Runx1Q03347 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Runx1Q03347 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Runx1Q03347 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Runx1Q03347 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Runx1Q03347 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Runx1Q03347 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Runx1Q03347 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Runx1Q03347 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Runx1Q03347 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Runx1Q03347 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Runx1Q03347 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Runx1Q03347 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Runx1Q03347 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Runx1Q03347 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Runx1Q03347 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Runx1Q03347 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Runx1Q03347 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Runx1Q03347 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Runx1Q03347 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Runx1Q03347 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms