Protein–RNA interactions for Protein: Q03146

Ddr1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, mousemouse

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Length 911 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddr1Q03146 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ddr1Q03146 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ddr1Q03146 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ddr1Q03146 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ddr1Q03146 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ddr1Q03146 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ddr1Q03146 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ddr1Q03146 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Ddr1Q03146 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ddr1Q03146 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ddr1Q03146 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ddr1Q03146 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ddr1Q03146 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ddr1Q03146 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ddr1Q03146 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ddr1Q03146 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ddr1Q03146 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ddr1Q03146 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ddr1Q03146 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ddr1Q03146 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ddr1Q03146 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ddr1Q03146 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ddr1Q03146 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Ddr1Q03146 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ddr1Q03146 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ddr1Q03146 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ddr1Q03146 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Ddr1Q03146 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ddr1Q03146 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Ddr1Q03146 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ddr1Q03146 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ddr1Q03146 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Ddr1Q03146 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ddr1Q03146 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ddr1Q03146 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Ddr1Q03146 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Ddr1Q03146 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ddr1Q03146 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ddr1Q03146 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ddr1Q03146 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ddr1Q03146 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Ddr1Q03146 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ddr1Q03146 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ddr1Q03146 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ddr1Q03146 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ddr1Q03146 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ddr1Q03146 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ddr1Q03146 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ddr1Q03146 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ddr1Q03146 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ddr1Q03146 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ddr1Q03146 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ddr1Q03146 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ddr1Q03146 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ddr1Q03146 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ddr1Q03146 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ddr1Q03146 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ddr1Q03146 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ddr1Q03146 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ddr1Q03146 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ddr1Q03146 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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