Protein–RNA interactions for Protein: Q01514

Gbp1, Guanylate-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp1Q01514 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbp1Q01514 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbp1Q01514 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbp1Q01514 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbp1Q01514 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbp1Q01514 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbp1Q01514 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbp1Q01514 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbp1Q01514 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbp1Q01514 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbp1Q01514 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbp1Q01514 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbp1Q01514 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbp1Q01514 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbp1Q01514 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbp1Q01514 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbp1Q01514 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbp1Q01514 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbp1Q01514 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbp1Q01514 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbp1Q01514 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbp1Q01514 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbp1Q01514 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbp1Q01514 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbp1Q01514 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbp1Q01514 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbp1Q01514 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gbp1Q01514 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gbp1Q01514 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gbp1Q01514 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gbp1Q01514 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gbp1Q01514 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gbp1Q01514 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gbp1Q01514 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gbp1Q01514 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gbp1Q01514 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gbp1Q01514 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gbp1Q01514 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gbp1Q01514 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gbp1Q01514 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gbp1Q01514 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gbp1Q01514 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gbp1Q01514 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gbp1Q01514 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gbp1Q01514 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gbp1Q01514 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gbp1Q01514 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gbp1Q01514 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gbp1Q01514 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gbp1Q01514 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gbp1Q01514 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gbp1Q01514 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gbp1Q01514 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gbp1Q01514 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gbp1Q01514 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gbp1Q01514 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gbp1Q01514 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gbp1Q01514 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gbp1Q01514 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gbp1Q01514 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gbp1Q01514 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gbp1Q01514 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gbp1Q01514 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gbp1Q01514 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gbp1Q01514 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gbp1Q01514 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gbp1Q01514 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gbp1Q01514 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gbp1Q01514 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gbp1Q01514 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gbp1Q01514 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gbp1Q01514 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gbp1Q01514 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gbp1Q01514 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gbp1Q01514 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gbp1Q01514 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gbp1Q01514 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gbp1Q01514 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gbp1Q01514 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gbp1Q01514 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gbp1Q01514 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gbp1Q01514 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gbp1Q01514 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gbp1Q01514 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gbp1Q01514 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gbp1Q01514 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gbp1Q01514 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gbp1Q01514 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gbp1Q01514 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gbp1Q01514 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gbp1Q01514 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gbp1Q01514 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gbp1Q01514 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gbp1Q01514 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gbp1Q01514 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gbp1Q01514 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gbp1Q01514 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gbp1Q01514 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gbp1Q01514 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gbp1Q01514 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms