Protein–RNA interactions for Protein: Q00342

Flt3, Receptor-type tyrosine-protein kinase FLT3, mousemouse

Predictions only

Length 1,000 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Flt3Q00342 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Flt3Q00342 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Flt3Q00342 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Flt3Q00342 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Flt3Q00342 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Flt3Q00342 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Flt3Q00342 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Flt3Q00342 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Flt3Q00342 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Flt3Q00342 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Flt3Q00342 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Flt3Q00342 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Flt3Q00342 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Flt3Q00342 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Flt3Q00342 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Flt3Q00342 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Flt3Q00342 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Flt3Q00342 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Flt3Q00342 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Flt3Q00342 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Flt3Q00342 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Flt3Q00342 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Flt3Q00342 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Flt3Q00342 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Flt3Q00342 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Flt3Q00342 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Flt3Q00342 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Flt3Q00342 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Flt3Q00342 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Flt3Q00342 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Flt3Q00342 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Flt3Q00342 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Flt3Q00342 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Flt3Q00342 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Flt3Q00342 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Flt3Q00342 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Flt3Q00342 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Flt3Q00342 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Flt3Q00342 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Flt3Q00342 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Flt3Q00342 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Flt3Q00342 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Flt3Q00342 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Flt3Q00342 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Flt3Q00342 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Flt3Q00342 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Flt3Q00342 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Flt3Q00342 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Flt3Q00342 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Flt3Q00342 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Flt3Q00342 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Flt3Q00342 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Flt3Q00342 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Flt3Q00342 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Flt3Q00342 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Flt3Q00342 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Flt3Q00342 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Flt3Q00342 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Flt3Q00342 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Flt3Q00342 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Flt3Q00342 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Flt3Q00342 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Flt3Q00342 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Flt3Q00342 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Flt3Q00342 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Flt3Q00342 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Flt3Q00342 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Flt3Q00342 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Flt3Q00342 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Flt3Q00342 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Flt3Q00342 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Flt3Q00342 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Flt3Q00342 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Flt3Q00342 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Flt3Q00342 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Flt3Q00342 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Flt3Q00342 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Flt3Q00342 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Flt3Q00342 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Flt3Q00342 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Flt3Q00342 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Flt3Q00342 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Flt3Q00342 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Flt3Q00342 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Flt3Q00342 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Flt3Q00342 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Flt3Q00342 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Flt3Q00342 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Flt3Q00342 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Flt3Q00342 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Flt3Q00342 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Flt3Q00342 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Flt3Q00342 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Flt3Q00342 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Flt3Q00342 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Flt3Q00342 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Flt3Q00342 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Flt3Q00342 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Flt3Q00342 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Flt3Q00342 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms