Protein–RNA interactions for Protein: Q00288

Pax8, Paired box protein Pax-8, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax8Q00288 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms