Protein–RNA interactions for Protein: P97386

Lig3, DNA ligase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,015 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig3P97386 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lig3P97386 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lig3P97386 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lig3P97386 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lig3P97386 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lig3P97386 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lig3P97386 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lig3P97386 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lig3P97386 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lig3P97386 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lig3P97386 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lig3P97386 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lig3P97386 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lig3P97386 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lig3P97386 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lig3P97386 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lig3P97386 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lig3P97386 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lig3P97386 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lig3P97386 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lig3P97386 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lig3P97386 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lig3P97386 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lig3P97386 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lig3P97386 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lig3P97386 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Lig3P97386 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lig3P97386 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Lig3P97386 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lig3P97386 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lig3P97386 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lig3P97386 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lig3P97386 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Lig3P97386 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lig3P97386 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Lig3P97386 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Lig3P97386 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lig3P97386 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lig3P97386 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lig3P97386 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lig3P97386 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lig3P97386 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lig3P97386 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lig3P97386 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lig3P97386 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lig3P97386 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lig3P97386 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lig3P97386 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lig3P97386 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lig3P97386 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lig3P97386 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lig3P97386 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lig3P97386 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lig3P97386 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lig3P97386 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Lig3P97386 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lig3P97386 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lig3P97386 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lig3P97386 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lig3P97386 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Lig3P97386 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Lig3P97386 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lig3P97386 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lig3P97386 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lig3P97386 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lig3P97386 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Lig3P97386 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lig3P97386 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lig3P97386 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lig3P97386 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lig3P97386 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lig3P97386 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lig3P97386 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lig3P97386 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lig3P97386 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lig3P97386 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lig3P97386 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lig3P97386 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lig3P97386 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lig3P97386 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lig3P97386 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lig3P97386 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lig3P97386 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lig3P97386 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lig3P97386 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lig3P97386 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lig3P97386 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lig3P97386 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lig3P97386 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lig3P97386 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Lig3P97386 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Lig3P97386 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Lig3P97386 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lig3P97386 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lig3P97386 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lig3P97386 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lig3P97386 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lig3P97386 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lig3P97386 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lig3P97386 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms