Protein–RNA interactions for Protein: P97358

Taf1b, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1bP97358 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Taf1bP97358 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Taf1bP97358 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Taf1bP97358 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Taf1bP97358 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Taf1bP97358 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Taf1bP97358 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Taf1bP97358 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Taf1bP97358 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Taf1bP97358 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Taf1bP97358 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Taf1bP97358 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Taf1bP97358 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Taf1bP97358 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Taf1bP97358 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Taf1bP97358 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Taf1bP97358 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Taf1bP97358 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Taf1bP97358 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Taf1bP97358 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Taf1bP97358 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Taf1bP97358 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Taf1bP97358 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Taf1bP97358 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Taf1bP97358 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Taf1bP97358 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Taf1bP97358 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Taf1bP97358 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Taf1bP97358 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Taf1bP97358 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Taf1bP97358 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Taf1bP97358 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Taf1bP97358 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Taf1bP97358 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Taf1bP97358 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Taf1bP97358 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Taf1bP97358 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Taf1bP97358 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Taf1bP97358 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Taf1bP97358 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Taf1bP97358 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Taf1bP97358 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Taf1bP97358 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Taf1bP97358 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Taf1bP97358 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Taf1bP97358 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Taf1bP97358 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Taf1bP97358 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Taf1bP97358 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Taf1bP97358 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf1bP97358 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf1bP97358 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf1bP97358 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf1bP97358 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf1bP97358 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf1bP97358 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf1bP97358 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf1bP97358 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf1bP97358 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf1bP97358 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf1bP97358 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf1bP97358 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf1bP97358 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf1bP97358 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf1bP97358 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf1bP97358 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf1bP97358 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf1bP97358 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf1bP97358 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf1bP97358 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf1bP97358 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf1bP97358 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf1bP97358 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf1bP97358 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf1bP97358 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf1bP97358 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf1bP97358 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf1bP97358 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf1bP97358 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf1bP97358 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf1bP97358 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf1bP97358 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf1bP97358 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf1bP97358 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf1bP97358 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf1bP97358 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf1bP97358 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf1bP97358 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf1bP97358 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf1bP97358 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf1bP97358 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf1bP97358 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf1bP97358 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf1bP97358 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf1bP97358 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf1bP97358 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf1bP97358 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf1bP97358 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf1bP97358 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf1bP97358 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms