Protein–RNA interactions for Protein: P97355

Sms, Spermine synthase, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmsP97355 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SmsP97355 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SmsP97355 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SmsP97355 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SmsP97355 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SmsP97355 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SmsP97355 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SmsP97355 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SmsP97355 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SmsP97355 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SmsP97355 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SmsP97355 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SmsP97355 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SmsP97355 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SmsP97355 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SmsP97355 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SmsP97355 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SmsP97355 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SmsP97355 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SmsP97355 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SmsP97355 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SmsP97355 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SmsP97355 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SmsP97355 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SmsP97355 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SmsP97355 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SmsP97355 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SmsP97355 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SmsP97355 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SmsP97355 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SmsP97355 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SmsP97355 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SmsP97355 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SmsP97355 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SmsP97355 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SmsP97355 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SmsP97355 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SmsP97355 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SmsP97355 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SmsP97355 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SmsP97355 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SmsP97355 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SmsP97355 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SmsP97355 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SmsP97355 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SmsP97355 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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SmsP97355 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SmsP97355 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SmsP97355 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SmsP97355 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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SmsP97355 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SmsP97355 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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SmsP97355 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SmsP97355 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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SmsP97355 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SmsP97355 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SmsP97355 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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SmsP97355 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SmsP97355 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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SmsP97355 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SmsP97355 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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SmsP97355 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SmsP97355 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SmsP97355 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SmsP97355 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SmsP97355 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SmsP97355 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SmsP97355 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SmsP97355 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SmsP97355 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SmsP97355 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SmsP97355 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SmsP97355 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SmsP97355 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SmsP97355 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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