Protein–RNA interactions for Protein: P83887

Tubg1, Tubulin gamma-1 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubg1P83887 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tubg1P83887 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tubg1P83887 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tubg1P83887 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tubg1P83887 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Tubg1P83887 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tubg1P83887 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tubg1P83887 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tubg1P83887 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tubg1P83887 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tubg1P83887 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tubg1P83887 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tubg1P83887 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tubg1P83887 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tubg1P83887 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tubg1P83887 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tubg1P83887 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tubg1P83887 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tubg1P83887 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tubg1P83887 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tubg1P83887 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tubg1P83887 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tubg1P83887 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tubg1P83887 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Tubg1P83887 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tubg1P83887 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tubg1P83887 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tubg1P83887 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tubg1P83887 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tubg1P83887 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Tubg1P83887 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tubg1P83887 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tubg1P83887 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tubg1P83887 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tubg1P83887 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tubg1P83887 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tubg1P83887 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Tubg1P83887 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tubg1P83887 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tubg1P83887 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tubg1P83887 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tubg1P83887 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Tubg1P83887 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tubg1P83887 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tubg1P83887 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tubg1P83887 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tubg1P83887 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tubg1P83887 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tubg1P83887 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tubg1P83887 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tubg1P83887 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tubg1P83887 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tubg1P83887 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tubg1P83887 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Tubg1P83887 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tubg1P83887 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tubg1P83887 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tubg1P83887 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tubg1P83887 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tubg1P83887 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tubg1P83887 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tubg1P83887 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tubg1P83887 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tubg1P83887 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tubg1P83887 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tubg1P83887 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tubg1P83887 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tubg1P83887 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Tubg1P83887 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tubg1P83887 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tubg1P83887 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tubg1P83887 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Tubg1P83887 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tubg1P83887 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Tubg1P83887 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tubg1P83887 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tubg1P83887 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tubg1P83887 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tubg1P83887 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tubg1P83887 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tubg1P83887 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tubg1P83887 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tubg1P83887 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tubg1P83887 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tubg1P83887 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tubg1P83887 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tubg1P83887 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tubg1P83887 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tubg1P83887 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tubg1P83887 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tubg1P83887 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tubg1P83887 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tubg1P83887 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Tubg1P83887 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Tubg1P83887 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Tubg1P83887 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Tubg1P83887 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Tubg1P83887 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Tubg1P83887 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Tubg1P83887 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms