Protein–RNA interactions for Protein: P70340

Smad1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, mousemouse

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Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad1P70340 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
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Smad1P70340 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smad1P70340 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smad1P70340 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smad1P70340 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smad1P70340 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smad1P70340 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smad1P70340 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smad1P70340 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smad1P70340 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smad1P70340 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smad1P70340 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smad1P70340 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smad1P70340 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smad1P70340 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smad1P70340 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smad1P70340 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Smad1P70340 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Smad1P70340 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smad1P70340 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Smad1P70340 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smad1P70340 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smad1P70340 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smad1P70340 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smad1P70340 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smad1P70340 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Smad1P70340 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smad1P70340 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smad1P70340 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smad1P70340 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smad1P70340 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smad1P70340 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smad1P70340 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smad1P70340 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smad1P70340 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smad1P70340 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smad1P70340 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smad1P70340 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smad1P70340 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smad1P70340 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smad1P70340 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Smad1P70340 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Smad1P70340 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smad1P70340 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Smad1P70340 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smad1P70340 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smad1P70340 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smad1P70340 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smad1P70340 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smad1P70340 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smad1P70340 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smad1P70340 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Smad1P70340 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Smad1P70340 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smad1P70340 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smad1P70340 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smad1P70340 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smad1P70340 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smad1P70340 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smad1P70340 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smad1P70340 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smad1P70340 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smad1P70340 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smad1P70340 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smad1P70340 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smad1P70340 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smad1P70340 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smad1P70340 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smad1P70340 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smad1P70340 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
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