Protein–RNA interactions for Protein: P70289

Ptprv, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase V, mousemouse

Predictions only

Length 1,705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PtprvP70289 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PtprvP70289 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PtprvP70289 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PtprvP70289 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
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PtprvP70289 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
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PtprvP70289 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PtprvP70289 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
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PtprvP70289 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PtprvP70289 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PtprvP70289 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PtprvP70289 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PtprvP70289 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PtprvP70289 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PtprvP70289 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PtprvP70289 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PtprvP70289 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PtprvP70289 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PtprvP70289 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PtprvP70289 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PtprvP70289 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PtprvP70289 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PtprvP70289 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PtprvP70289 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PtprvP70289 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PtprvP70289 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PtprvP70289 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PtprvP70289 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PtprvP70289 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PtprvP70289 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms