Protein–RNA interactions for Protein: P70268

Pkn1, Serine/threonine-protein kinase N1, mousemouse

Predictions only

Length 946 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn1P70268 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Pkn1P70268 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pkn1P70268 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Pkn1P70268 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pkn1P70268 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pkn1P70268 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pkn1P70268 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pkn1P70268 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Pkn1P70268 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Pkn1P70268 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Pkn1P70268 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pkn1P70268 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pkn1P70268 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Pkn1P70268 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pkn1P70268 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pkn1P70268 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pkn1P70268 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pkn1P70268 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pkn1P70268 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Pkn1P70268 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pkn1P70268 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkn1P70268 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkn1P70268 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkn1P70268 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkn1P70268 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkn1P70268 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkn1P70268 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkn1P70268 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkn1P70268 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkn1P70268 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkn1P70268 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkn1P70268 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkn1P70268 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkn1P70268 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkn1P70268 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkn1P70268 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkn1P70268 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkn1P70268 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkn1P70268 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkn1P70268 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkn1P70268 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkn1P70268 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkn1P70268 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkn1P70268 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkn1P70268 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkn1P70268 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkn1P70268 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkn1P70268 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkn1P70268 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkn1P70268 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkn1P70268 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkn1P70268 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkn1P70268 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkn1P70268 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkn1P70268 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkn1P70268 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkn1P70268 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkn1P70268 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkn1P70268 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkn1P70268 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkn1P70268 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkn1P70268 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkn1P70268 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkn1P70268 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkn1P70268 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkn1P70268 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkn1P70268 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkn1P70268 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkn1P70268 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkn1P70268 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkn1P70268 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkn1P70268 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkn1P70268 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkn1P70268 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkn1P70268 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkn1P70268 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkn1P70268 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkn1P70268 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkn1P70268 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkn1P70268 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkn1P70268 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkn1P70268 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkn1P70268 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkn1P70268 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkn1P70268 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkn1P70268 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkn1P70268 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkn1P70268 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkn1P70268 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkn1P70268 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkn1P70268 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkn1P70268 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkn1P70268 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkn1P70268 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkn1P70268 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkn1P70268 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkn1P70268 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkn1P70268 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkn1P70268 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkn1P70268 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms