Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SbdsP70122 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SbdsP70122 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SbdsP70122 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SbdsP70122 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SbdsP70122 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SbdsP70122 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SbdsP70122 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SbdsP70122 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SbdsP70122 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SbdsP70122 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SbdsP70122 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SbdsP70122 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SbdsP70122 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SbdsP70122 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SbdsP70122 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SbdsP70122 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SbdsP70122 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SbdsP70122 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SbdsP70122 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SbdsP70122 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SbdsP70122 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SbdsP70122 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SbdsP70122 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SbdsP70122 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SbdsP70122 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SbdsP70122 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SbdsP70122 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SbdsP70122 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SbdsP70122 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SbdsP70122 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SbdsP70122 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SbdsP70122 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SbdsP70122 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SbdsP70122 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SbdsP70122 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SbdsP70122 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SbdsP70122 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SbdsP70122 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SbdsP70122 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SbdsP70122 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SbdsP70122 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SbdsP70122 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SbdsP70122 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SbdsP70122 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SbdsP70122 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SbdsP70122 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SbdsP70122 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SbdsP70122 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SbdsP70122 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SbdsP70122 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SbdsP70122 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SbdsP70122 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SbdsP70122 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SbdsP70122 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SbdsP70122 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SbdsP70122 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SbdsP70122 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SbdsP70122 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SbdsP70122 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SbdsP70122 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SbdsP70122 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SbdsP70122 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SbdsP70122 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SbdsP70122 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SbdsP70122 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SbdsP70122 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SbdsP70122 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SbdsP70122 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SbdsP70122 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SbdsP70122 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SbdsP70122 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SbdsP70122 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SbdsP70122 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SbdsP70122 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SbdsP70122 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SbdsP70122 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SbdsP70122 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SbdsP70122 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SbdsP70122 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SbdsP70122 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SbdsP70122 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SbdsP70122 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SbdsP70122 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SbdsP70122 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SbdsP70122 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SbdsP70122 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SbdsP70122 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SbdsP70122 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SbdsP70122 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SbdsP70122 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SbdsP70122 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SbdsP70122 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SbdsP70122 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SbdsP70122 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SbdsP70122 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SbdsP70122 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SbdsP70122 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SbdsP70122 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SbdsP70122 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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