Protein–RNA interactions for Protein: P63006

Lhx1, LIM/homeobox protein Lhx1, mousemouse

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx1P63006 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Lhx1P63006 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lhx1P63006 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lhx1P63006 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lhx1P63006 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lhx1P63006 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lhx1P63006 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lhx1P63006 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lhx1P63006 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lhx1P63006 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lhx1P63006 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lhx1P63006 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lhx1P63006 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lhx1P63006 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lhx1P63006 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lhx1P63006 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lhx1P63006 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lhx1P63006 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lhx1P63006 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lhx1P63006 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Lhx1P63006 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lhx1P63006 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lhx1P63006 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lhx1P63006 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lhx1P63006 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lhx1P63006 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Lhx1P63006 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lhx1P63006 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Lhx1P63006 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lhx1P63006 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lhx1P63006 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Lhx1P63006 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lhx1P63006 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Lhx1P63006 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lhx1P63006 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lhx1P63006 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lhx1P63006 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lhx1P63006 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lhx1P63006 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lhx1P63006 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lhx1P63006 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lhx1P63006 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lhx1P63006 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lhx1P63006 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lhx1P63006 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lhx1P63006 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lhx1P63006 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Lhx1P63006 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lhx1P63006 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lhx1P63006 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lhx1P63006 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lhx1P63006 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lhx1P63006 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lhx1P63006 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lhx1P63006 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lhx1P63006 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lhx1P63006 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lhx1P63006 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lhx1P63006 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lhx1P63006 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lhx1P63006 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lhx1P63006 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lhx1P63006 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lhx1P63006 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lhx1P63006 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Lhx1P63006 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lhx1P63006 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lhx1P63006 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lhx1P63006 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lhx1P63006 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Lhx1P63006 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lhx1P63006 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lhx1P63006 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lhx1P63006 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lhx1P63006 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lhx1P63006 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lhx1P63006 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lhx1P63006 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lhx1P63006 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lhx1P63006 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lhx1P63006 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lhx1P63006 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lhx1P63006 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lhx1P63006 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lhx1P63006 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lhx1P63006 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lhx1P63006 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lhx1P63006 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lhx1P63006 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lhx1P63006 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lhx1P63006 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lhx1P63006 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lhx1P63006 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lhx1P63006 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lhx1P63006 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lhx1P63006 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lhx1P63006 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lhx1P63006 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lhx1P63006 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lhx1P63006 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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