Protein–RNA interactions for Protein: P60824

Cirbp, Cold-inducible RNA-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CirbpP60824 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
CirbpP60824 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
CirbpP60824 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
CirbpP60824 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
CirbpP60824 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
CirbpP60824 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
CirbpP60824 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
CirbpP60824 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
CirbpP60824 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
CirbpP60824 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
CirbpP60824 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
CirbpP60824 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
CirbpP60824 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
CirbpP60824 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
CirbpP60824 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
CirbpP60824 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
CirbpP60824 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
CirbpP60824 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
CirbpP60824 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
CirbpP60824 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
CirbpP60824 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
CirbpP60824 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
CirbpP60824 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
CirbpP60824 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
CirbpP60824 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
CirbpP60824 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CirbpP60824 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
CirbpP60824 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CirbpP60824 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CirbpP60824 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
CirbpP60824 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CirbpP60824 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
CirbpP60824 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CirbpP60824 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CirbpP60824 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CirbpP60824 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CirbpP60824 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CirbpP60824 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
CirbpP60824 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
CirbpP60824 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
CirbpP60824 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CirbpP60824 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CirbpP60824 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CirbpP60824 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CirbpP60824 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
CirbpP60824 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CirbpP60824 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
CirbpP60824 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CirbpP60824 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
CirbpP60824 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CirbpP60824 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CirbpP60824 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
CirbpP60824 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
CirbpP60824 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
CirbpP60824 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
CirbpP60824 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
CirbpP60824 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
CirbpP60824 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
CirbpP60824 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
CirbpP60824 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
CirbpP60824 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
CirbpP60824 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CirbpP60824 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
CirbpP60824 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CirbpP60824 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CirbpP60824 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CirbpP60824 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
CirbpP60824 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
CirbpP60824 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CirbpP60824 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
CirbpP60824 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CirbpP60824 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CirbpP60824 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CirbpP60824 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
CirbpP60824 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CirbpP60824 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CirbpP60824 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CirbpP60824 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CirbpP60824 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CirbpP60824 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CirbpP60824 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
CirbpP60824 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
CirbpP60824 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
CirbpP60824 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CirbpP60824 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CirbpP60824 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CirbpP60824 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CirbpP60824 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CirbpP60824 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
CirbpP60824 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
CirbpP60824 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CirbpP60824 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CirbpP60824 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
CirbpP60824 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CirbpP60824 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CirbpP60824 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CirbpP60824 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CirbpP60824 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
CirbpP60824 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
CirbpP60824 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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