Protein–RNA interactions for Protein: P60335

Pcbp1, Poly(rC)-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcbp1P60335 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pcbp1P60335 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pcbp1P60335 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pcbp1P60335 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pcbp1P60335 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pcbp1P60335 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pcbp1P60335 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pcbp1P60335 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pcbp1P60335 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pcbp1P60335 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pcbp1P60335 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pcbp1P60335 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Pcbp1P60335 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Pcbp1P60335 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Pcbp1P60335 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pcbp1P60335 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pcbp1P60335 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pcbp1P60335 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pcbp1P60335 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pcbp1P60335 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pcbp1P60335 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pcbp1P60335 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pcbp1P60335 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pcbp1P60335 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pcbp1P60335 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pcbp1P60335 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pcbp1P60335 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pcbp1P60335 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pcbp1P60335 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pcbp1P60335 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pcbp1P60335 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pcbp1P60335 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pcbp1P60335 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pcbp1P60335 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pcbp1P60335 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pcbp1P60335 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pcbp1P60335 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pcbp1P60335 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pcbp1P60335 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pcbp1P60335 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pcbp1P60335 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pcbp1P60335 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pcbp1P60335 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pcbp1P60335 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pcbp1P60335 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pcbp1P60335 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Pcbp1P60335 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Pcbp1P60335 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pcbp1P60335 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pcbp1P60335 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pcbp1P60335 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pcbp1P60335 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pcbp1P60335 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pcbp1P60335 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pcbp1P60335 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pcbp1P60335 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pcbp1P60335 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pcbp1P60335 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pcbp1P60335 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pcbp1P60335 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pcbp1P60335 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pcbp1P60335 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pcbp1P60335 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pcbp1P60335 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Pcbp1P60335 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Pcbp1P60335 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pcbp1P60335 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pcbp1P60335 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pcbp1P60335 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Pcbp1P60335 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pcbp1P60335 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pcbp1P60335 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pcbp1P60335 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pcbp1P60335 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pcbp1P60335 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pcbp1P60335 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pcbp1P60335 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pcbp1P60335 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pcbp1P60335 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pcbp1P60335 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Pcbp1P60335 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pcbp1P60335 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pcbp1P60335 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pcbp1P60335 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pcbp1P60335 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pcbp1P60335 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pcbp1P60335 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pcbp1P60335 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pcbp1P60335 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pcbp1P60335 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pcbp1P60335 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Pcbp1P60335 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pcbp1P60335 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pcbp1P60335 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Pcbp1P60335 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pcbp1P60335 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pcbp1P60335 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pcbp1P60335 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pcbp1P60335 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pcbp1P60335 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms