Protein–RNA interactions for Protein: P56183

Rrp1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1P56183 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rrp1P56183 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rrp1P56183 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rrp1P56183 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rrp1P56183 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rrp1P56183 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rrp1P56183 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rrp1P56183 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rrp1P56183 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rrp1P56183 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rrp1P56183 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rrp1P56183 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rrp1P56183 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Rrp1P56183 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rrp1P56183 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Rrp1P56183 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rrp1P56183 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rrp1P56183 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Rrp1P56183 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rrp1P56183 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Rrp1P56183 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rrp1P56183 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rrp1P56183 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rrp1P56183 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rrp1P56183 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rrp1P56183 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rrp1P56183 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rrp1P56183 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rrp1P56183 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rrp1P56183 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rrp1P56183 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rrp1P56183 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rrp1P56183 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rrp1P56183 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rrp1P56183 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rrp1P56183 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rrp1P56183 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rrp1P56183 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rrp1P56183 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rrp1P56183 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rrp1P56183 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rrp1P56183 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rrp1P56183 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rrp1P56183 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Rrp1P56183 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rrp1P56183 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rrp1P56183 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Rrp1P56183 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Rrp1P56183 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Rrp1P56183 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rrp1P56183 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rrp1P56183 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rrp1P56183 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rrp1P56183 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rrp1P56183 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rrp1P56183 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Rrp1P56183 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rrp1P56183 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rrp1P56183 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rrp1P56183 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rrp1P56183 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rrp1P56183 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rrp1P56183 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rrp1P56183 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rrp1P56183 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rrp1P56183 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rrp1P56183 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rrp1P56183 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rrp1P56183 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rrp1P56183 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rrp1P56183 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rrp1P56183 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rrp1P56183 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rrp1P56183 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rrp1P56183 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rrp1P56183 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rrp1P56183 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rrp1P56183 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rrp1P56183 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rrp1P56183 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rrp1P56183 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rrp1P56183 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rrp1P56183 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rrp1P56183 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rrp1P56183 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rrp1P56183 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rrp1P56183 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rrp1P56183 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rrp1P56183 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rrp1P56183 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rrp1P56183 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rrp1P56183 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rrp1P56183 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rrp1P56183 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rrp1P56183 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rrp1P56183 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rrp1P56183 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rrp1P56183 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rrp1P56183 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rrp1P56183 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms