Protein–RNA interactions for Protein: P48787

Tnni3, Troponin I, cardiac muscle, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni3P48787 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnni3P48787 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnni3P48787 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnni3P48787 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnni3P48787 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnni3P48787 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnni3P48787 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnni3P48787 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnni3P48787 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnni3P48787 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnni3P48787 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnni3P48787 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnni3P48787 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnni3P48787 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnni3P48787 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnni3P48787 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnni3P48787 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnni3P48787 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnni3P48787 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnni3P48787 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnni3P48787 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnni3P48787 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnni3P48787 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnni3P48787 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnni3P48787 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnni3P48787 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnni3P48787 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnni3P48787 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnni3P48787 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnni3P48787 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnni3P48787 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnni3P48787 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnni3P48787 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnni3P48787 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnni3P48787 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnni3P48787 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnni3P48787 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnni3P48787 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnni3P48787 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnni3P48787 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnni3P48787 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnni3P48787 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnni3P48787 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnni3P48787 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnni3P48787 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnni3P48787 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnni3P48787 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnni3P48787 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnni3P48787 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnni3P48787 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnni3P48787 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnni3P48787 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnni3P48787 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnni3P48787 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnni3P48787 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnni3P48787 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnni3P48787 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnni3P48787 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnni3P48787 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnni3P48787 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnni3P48787 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnni3P48787 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnni3P48787 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnni3P48787 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tnni3P48787 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tnni3P48787 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tnni3P48787 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tnni3P48787 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tnni3P48787 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnni3P48787 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnni3P48787 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnni3P48787 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnni3P48787 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnni3P48787 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnni3P48787 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnni3P48787 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnni3P48787 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnni3P48787 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnni3P48787 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnni3P48787 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnni3P48787 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnni3P48787 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnni3P48787 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnni3P48787 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnni3P48787 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnni3P48787 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnni3P48787 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnni3P48787 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnni3P48787 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnni3P48787 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnni3P48787 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnni3P48787 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnni3P48787 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnni3P48787 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnni3P48787 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnni3P48787 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnni3P48787 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnni3P48787 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnni3P48787 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnni3P48787 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms