Protein–RNA interactions for Protein: P46414

Cdkn1b, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1bP46414 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms