Protein–RNA interactions for Protein: P43406

Itgav, Integrin alpha-V, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgavP43406 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ItgavP43406 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ItgavP43406 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ItgavP43406 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ItgavP43406 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ItgavP43406 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ItgavP43406 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ItgavP43406 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ItgavP43406 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
ItgavP43406 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ItgavP43406 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ItgavP43406 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ItgavP43406 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ItgavP43406 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ItgavP43406 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ItgavP43406 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ItgavP43406 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ItgavP43406 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ItgavP43406 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ItgavP43406 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ItgavP43406 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
ItgavP43406 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
ItgavP43406 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
ItgavP43406 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ItgavP43406 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ItgavP43406 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ItgavP43406 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ItgavP43406 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ItgavP43406 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ItgavP43406 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ItgavP43406 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
ItgavP43406 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ItgavP43406 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ItgavP43406 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ItgavP43406 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ItgavP43406 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ItgavP43406 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ItgavP43406 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ItgavP43406 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ItgavP43406 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ItgavP43406 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ItgavP43406 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ItgavP43406 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ItgavP43406 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ItgavP43406 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ItgavP43406 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ItgavP43406 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ItgavP43406 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ItgavP43406 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
ItgavP43406 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ItgavP43406 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ItgavP43406 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ItgavP43406 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ItgavP43406 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ItgavP43406 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ItgavP43406 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ItgavP43406 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
ItgavP43406 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ItgavP43406 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
ItgavP43406 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ItgavP43406 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ItgavP43406 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ItgavP43406 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ItgavP43406 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ItgavP43406 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ItgavP43406 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ItgavP43406 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ItgavP43406 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ItgavP43406 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ItgavP43406 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ItgavP43406 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ItgavP43406 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ItgavP43406 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ItgavP43406 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ItgavP43406 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ItgavP43406 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ItgavP43406 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ItgavP43406 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ItgavP43406 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ItgavP43406 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ItgavP43406 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ItgavP43406 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ItgavP43406 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
ItgavP43406 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ItgavP43406 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ItgavP43406 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ItgavP43406 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ItgavP43406 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ItgavP43406 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
ItgavP43406 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
ItgavP43406 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ItgavP43406 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ItgavP43406 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ItgavP43406 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ItgavP43406 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ItgavP43406 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ItgavP43406 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ItgavP43406 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ItgavP43406 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
ItgavP43406 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms