Protein–RNA interactions for Protein: P41274

Tnfsf9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, mousemouse

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Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf9P41274 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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