Protein–RNA interactions for Protein: P40630

Tfam, Transcription factor A, mitochondrial, mousemouse

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Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TfamP40630 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TfamP40630 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TfamP40630 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
TfamP40630 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TfamP40630 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TfamP40630 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
TfamP40630 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TfamP40630 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TfamP40630 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
TfamP40630 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TfamP40630 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TfamP40630 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TfamP40630 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TfamP40630 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TfamP40630 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TfamP40630 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TfamP40630 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TfamP40630 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TfamP40630 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TfamP40630 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TfamP40630 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TfamP40630 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TfamP40630 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TfamP40630 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TfamP40630 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TfamP40630 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TfamP40630 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TfamP40630 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TfamP40630 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TfamP40630 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TfamP40630 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TfamP40630 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TfamP40630 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TfamP40630 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TfamP40630 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TfamP40630 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TfamP40630 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
TfamP40630 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
TfamP40630 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
TfamP40630 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
TfamP40630 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TfamP40630 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TfamP40630 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TfamP40630 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TfamP40630 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TfamP40630 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TfamP40630 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TfamP40630 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TfamP40630 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TfamP40630 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TfamP40630 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TfamP40630 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TfamP40630 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
TfamP40630 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
TfamP40630 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
TfamP40630 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
TfamP40630 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
TfamP40630 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
TfamP40630 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
TfamP40630 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
TfamP40630 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
TfamP40630 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
TfamP40630 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
TfamP40630 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
TfamP40630 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
TfamP40630 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
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TfamP40630 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
TfamP40630 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
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TfamP40630 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
TfamP40630 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
TfamP40630 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
TfamP40630 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
TfamP40630 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TfamP40630 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TfamP40630 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TfamP40630 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TfamP40630 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TfamP40630 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TfamP40630 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
TfamP40630 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TfamP40630 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TfamP40630 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TfamP40630 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TfamP40630 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TfamP40630 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TfamP40630 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TfamP40630 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TfamP40630 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TfamP40630 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TfamP40630 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TfamP40630 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TfamP40630 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TfamP40630 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TfamP40630 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TfamP40630 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TfamP40630 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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