Protein–RNA interactions for Protein: P35639

Ddit3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddit3P35639 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ddit3P35639 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ddit3P35639 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ddit3P35639 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ddit3P35639 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ddit3P35639 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ddit3P35639 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ddit3P35639 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ddit3P35639 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ddit3P35639 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ddit3P35639 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ddit3P35639 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ddit3P35639 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ddit3P35639 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ddit3P35639 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ddit3P35639 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ddit3P35639 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ddit3P35639 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ddit3P35639 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ddit3P35639 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ddit3P35639 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ddit3P35639 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ddit3P35639 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ddit3P35639 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ddit3P35639 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ddit3P35639 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ddit3P35639 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ddit3P35639 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ddit3P35639 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ddit3P35639 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ddit3P35639 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ddit3P35639 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ddit3P35639 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ddit3P35639 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ddit3P35639 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ddit3P35639 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ddit3P35639 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ddit3P35639 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ddit3P35639 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ddit3P35639 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ddit3P35639 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ddit3P35639 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ddit3P35639 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ddit3P35639 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ddit3P35639 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ddit3P35639 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ddit3P35639 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ddit3P35639 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ddit3P35639 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ddit3P35639 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ddit3P35639 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ddit3P35639 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ddit3P35639 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ddit3P35639 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ddit3P35639 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ddit3P35639 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ddit3P35639 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ddit3P35639 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ddit3P35639 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ddit3P35639 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ddit3P35639 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ddit3P35639 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ddit3P35639 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ddit3P35639 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ddit3P35639 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ddit3P35639 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ddit3P35639 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ddit3P35639 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ddit3P35639 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ddit3P35639 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ddit3P35639 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ddit3P35639 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ddit3P35639 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ddit3P35639 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ddit3P35639 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ddit3P35639 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ddit3P35639 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ddit3P35639 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ddit3P35639 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ddit3P35639 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ddit3P35639 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ddit3P35639 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ddit3P35639 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ddit3P35639 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ddit3P35639 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ddit3P35639 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ddit3P35639 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ddit3P35639 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ddit3P35639 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ddit3P35639 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ddit3P35639 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ddit3P35639 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ddit3P35639 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ddit3P35639 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ddit3P35639 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ddit3P35639 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ddit3P35639 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ddit3P35639 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ddit3P35639 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ddit3P35639 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms