Protein–RNA interactions for Protein: P30999

Ctnnd1, Catenin delta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 938 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnd1P30999 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctnnd1P30999 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctnnd1P30999 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctnnd1P30999 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctnnd1P30999 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctnnd1P30999 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctnnd1P30999 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctnnd1P30999 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctnnd1P30999 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctnnd1P30999 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctnnd1P30999 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctnnd1P30999 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctnnd1P30999 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctnnd1P30999 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctnnd1P30999 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctnnd1P30999 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctnnd1P30999 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctnnd1P30999 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctnnd1P30999 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctnnd1P30999 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctnnd1P30999 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctnnd1P30999 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctnnd1P30999 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctnnd1P30999 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctnnd1P30999 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctnnd1P30999 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctnnd1P30999 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctnnd1P30999 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctnnd1P30999 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctnnd1P30999 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctnnd1P30999 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctnnd1P30999 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctnnd1P30999 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctnnd1P30999 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctnnd1P30999 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctnnd1P30999 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctnnd1P30999 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctnnd1P30999 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctnnd1P30999 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctnnd1P30999 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctnnd1P30999 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctnnd1P30999 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctnnd1P30999 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctnnd1P30999 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctnnd1P30999 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctnnd1P30999 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctnnd1P30999 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctnnd1P30999 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctnnd1P30999 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctnnd1P30999 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctnnd1P30999 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctnnd1P30999 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctnnd1P30999 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctnnd1P30999 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctnnd1P30999 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctnnd1P30999 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctnnd1P30999 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctnnd1P30999 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctnnd1P30999 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctnnd1P30999 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctnnd1P30999 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctnnd1P30999 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctnnd1P30999 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctnnd1P30999 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctnnd1P30999 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctnnd1P30999 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctnnd1P30999 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctnnd1P30999 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctnnd1P30999 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctnnd1P30999 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctnnd1P30999 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctnnd1P30999 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctnnd1P30999 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctnnd1P30999 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctnnd1P30999 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctnnd1P30999 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctnnd1P30999 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctnnd1P30999 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctnnd1P30999 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctnnd1P30999 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctnnd1P30999 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctnnd1P30999 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctnnd1P30999 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctnnd1P30999 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctnnd1P30999 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctnnd1P30999 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctnnd1P30999 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctnnd1P30999 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctnnd1P30999 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctnnd1P30999 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctnnd1P30999 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctnnd1P30999 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctnnd1P30999 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctnnd1P30999 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctnnd1P30999 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctnnd1P30999 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctnnd1P30999 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctnnd1P30999 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctnnd1P30999 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctnnd1P30999 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms