Protein–RNA interactions for Protein: P29533

Vcam1, Vascular cell adhesion protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vcam1P29533 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vcam1P29533 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vcam1P29533 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vcam1P29533 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vcam1P29533 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vcam1P29533 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vcam1P29533 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vcam1P29533 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vcam1P29533 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vcam1P29533 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vcam1P29533 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vcam1P29533 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vcam1P29533 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vcam1P29533 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vcam1P29533 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vcam1P29533 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vcam1P29533 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vcam1P29533 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vcam1P29533 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vcam1P29533 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vcam1P29533 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vcam1P29533 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vcam1P29533 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Vcam1P29533 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Vcam1P29533 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vcam1P29533 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vcam1P29533 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vcam1P29533 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vcam1P29533 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vcam1P29533 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vcam1P29533 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Vcam1P29533 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vcam1P29533 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vcam1P29533 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vcam1P29533 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vcam1P29533 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vcam1P29533 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vcam1P29533 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vcam1P29533 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Vcam1P29533 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vcam1P29533 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vcam1P29533 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vcam1P29533 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vcam1P29533 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vcam1P29533 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vcam1P29533 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vcam1P29533 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Vcam1P29533 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Vcam1P29533 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vcam1P29533 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vcam1P29533 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Vcam1P29533 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Vcam1P29533 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vcam1P29533 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vcam1P29533 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vcam1P29533 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vcam1P29533 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vcam1P29533 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vcam1P29533 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vcam1P29533 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vcam1P29533 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vcam1P29533 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vcam1P29533 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vcam1P29533 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vcam1P29533 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vcam1P29533 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vcam1P29533 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vcam1P29533 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Vcam1P29533 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Vcam1P29533 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Vcam1P29533 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vcam1P29533 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vcam1P29533 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vcam1P29533 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vcam1P29533 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vcam1P29533 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vcam1P29533 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vcam1P29533 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vcam1P29533 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vcam1P29533 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vcam1P29533 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vcam1P29533 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vcam1P29533 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vcam1P29533 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vcam1P29533 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vcam1P29533 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vcam1P29533 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Vcam1P29533 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vcam1P29533 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vcam1P29533 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vcam1P29533 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Vcam1P29533 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vcam1P29533 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Vcam1P29533 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vcam1P29533 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vcam1P29533 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vcam1P29533 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Vcam1P29533 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vcam1P29533 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Vcam1P29533 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms