Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PrkchP23298 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PrkchP23298 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PrkchP23298 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PrkchP23298 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PrkchP23298 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PrkchP23298 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PrkchP23298 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PrkchP23298 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PrkchP23298 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PrkchP23298 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PrkchP23298 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PrkchP23298 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PrkchP23298 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PrkchP23298 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PrkchP23298 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PrkchP23298 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PrkchP23298 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PrkchP23298 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PrkchP23298 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PrkchP23298 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PrkchP23298 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PrkchP23298 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PrkchP23298 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PrkchP23298 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PrkchP23298 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PrkchP23298 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PrkchP23298 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PrkchP23298 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PrkchP23298 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PrkchP23298 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PrkchP23298 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PrkchP23298 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PrkchP23298 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PrkchP23298 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PrkchP23298 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PrkchP23298 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PrkchP23298 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PrkchP23298 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PrkchP23298 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PrkchP23298 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PrkchP23298 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PrkchP23298 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PrkchP23298 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PrkchP23298 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PrkchP23298 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PrkchP23298 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PrkchP23298 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PrkchP23298 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PrkchP23298 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PrkchP23298 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PrkchP23298 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PrkchP23298 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PrkchP23298 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PrkchP23298 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PrkchP23298 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PrkchP23298 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PrkchP23298 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.07
PrkchP23298 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PrkchP23298 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PrkchP23298 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PrkchP23298 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PrkchP23298 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PrkchP23298 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PrkchP23298 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PrkchP23298 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PrkchP23298 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PrkchP23298 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PrkchP23298 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PrkchP23298 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PrkchP23298 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PrkchP23298 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PrkchP23298 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PrkchP23298 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PrkchP23298 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PrkchP23298 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PrkchP23298 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PrkchP23298 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PrkchP23298 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PrkchP23298 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PrkchP23298 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PrkchP23298 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PrkchP23298 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PrkchP23298 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PrkchP23298 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PrkchP23298 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PrkchP23298 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PrkchP23298 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PrkchP23298 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PrkchP23298 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PrkchP23298 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PrkchP23298 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PrkchP23298 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PrkchP23298 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PrkchP23298 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PrkchP23298 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PrkchP23298 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PrkchP23298 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PrkchP23298 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PrkchP23298 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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