Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PparaP23204 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PparaP23204 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PparaP23204 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PparaP23204 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PparaP23204 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PparaP23204 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PparaP23204 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PparaP23204 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PparaP23204 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PparaP23204 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PparaP23204 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PparaP23204 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PparaP23204 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PparaP23204 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PparaP23204 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PparaP23204 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PparaP23204 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PparaP23204 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PparaP23204 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PparaP23204 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PparaP23204 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PparaP23204 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PparaP23204 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PparaP23204 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PparaP23204 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PparaP23204 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PparaP23204 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PparaP23204 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PparaP23204 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PparaP23204 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PparaP23204 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PparaP23204 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PparaP23204 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PparaP23204 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PparaP23204 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PparaP23204 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PparaP23204 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PparaP23204 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PparaP23204 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PparaP23204 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PparaP23204 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PparaP23204 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PparaP23204 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PparaP23204 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PparaP23204 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PparaP23204 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PparaP23204 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PparaP23204 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PparaP23204 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PparaP23204 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PparaP23204 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PparaP23204 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PparaP23204 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PparaP23204 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PparaP23204 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PparaP23204 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PparaP23204 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PparaP23204 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PparaP23204 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PparaP23204 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PparaP23204 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PparaP23204 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PparaP23204 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PparaP23204 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PparaP23204 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PparaP23204 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PparaP23204 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PparaP23204 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PparaP23204 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PparaP23204 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PparaP23204 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PparaP23204 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PparaP23204 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PparaP23204 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PparaP23204 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PparaP23204 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PparaP23204 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PparaP23204 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PparaP23204 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PparaP23204 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PparaP23204 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PparaP23204 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PparaP23204 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PparaP23204 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PparaP23204 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PparaP23204 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PparaP23204 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PparaP23204 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PparaP23204 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PparaP23204 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PparaP23204 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PparaP23204 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PparaP23204 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PparaP23204 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PparaP23204 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PparaP23204 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PparaP23204 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PparaP23204 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PparaP23204 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms