Protein–RNA interactions for Protein: P20615

Hoxb9, Homeobox protein Hox-B9, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb9P20615 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxb9P20615 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxb9P20615 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxb9P20615 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxb9P20615 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxb9P20615 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxb9P20615 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxb9P20615 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxb9P20615 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxb9P20615 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxb9P20615 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxb9P20615 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxb9P20615 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxb9P20615 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxb9P20615 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxb9P20615 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxb9P20615 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxb9P20615 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxb9P20615 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxb9P20615 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxb9P20615 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxb9P20615 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxb9P20615 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxb9P20615 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxb9P20615 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxb9P20615 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxb9P20615 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxb9P20615 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxb9P20615 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxb9P20615 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxb9P20615 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxb9P20615 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxb9P20615 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxb9P20615 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxb9P20615 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxb9P20615 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxb9P20615 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxb9P20615 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxb9P20615 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxb9P20615 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxb9P20615 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxb9P20615 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxb9P20615 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxb9P20615 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxb9P20615 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxb9P20615 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxb9P20615 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxb9P20615 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxb9P20615 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxb9P20615 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxb9P20615 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxb9P20615 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxb9P20615 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxb9P20615 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxb9P20615 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxb9P20615 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxb9P20615 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxb9P20615 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxb9P20615 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxb9P20615 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxb9P20615 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxb9P20615 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxb9P20615 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxb9P20615 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxb9P20615 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxb9P20615 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxb9P20615 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxb9P20615 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxb9P20615 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxb9P20615 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxb9P20615 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxb9P20615 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxb9P20615 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxb9P20615 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxb9P20615 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxb9P20615 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxb9P20615 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxb9P20615 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxb9P20615 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxb9P20615 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxb9P20615 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxb9P20615 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxb9P20615 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxb9P20615 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxb9P20615 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxb9P20615 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxb9P20615 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxb9P20615 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxb9P20615 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxb9P20615 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxb9P20615 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxb9P20615 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxb9P20615 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxb9P20615 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxb9P20615 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxb9P20615 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxb9P20615 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxb9P20615 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxb9P20615 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxb9P20615 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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