Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.1 ms