Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tnnc1P19123 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tnnc1P19123 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnnc1P19123 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnnc1P19123 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnnc1P19123 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnnc1P19123 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnnc1P19123 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnnc1P19123 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnnc1P19123 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnnc1P19123 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnnc1P19123 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnnc1P19123 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnnc1P19123 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnnc1P19123 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnnc1P19123 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnnc1P19123 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnnc1P19123 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnnc1P19123 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnnc1P19123 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnnc1P19123 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnnc1P19123 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnnc1P19123 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnnc1P19123 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnnc1P19123 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnnc1P19123 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnnc1P19123 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnnc1P19123 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnnc1P19123 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnnc1P19123 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnnc1P19123 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnnc1P19123 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnnc1P19123 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnnc1P19123 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnnc1P19123 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnnc1P19123 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnnc1P19123 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnnc1P19123 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnnc1P19123 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnnc1P19123 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnnc1P19123 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnnc1P19123 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnnc1P19123 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnnc1P19123 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnnc1P19123 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnnc1P19123 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnnc1P19123 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnnc1P19123 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnnc1P19123 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnnc1P19123 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnnc1P19123 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnnc1P19123 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnnc1P19123 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnnc1P19123 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnnc1P19123 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnnc1P19123 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnnc1P19123 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnnc1P19123 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnnc1P19123 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnnc1P19123 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnnc1P19123 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnnc1P19123 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnnc1P19123 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnnc1P19123 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnnc1P19123 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnnc1P19123 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnnc1P19123 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnnc1P19123 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnnc1P19123 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnnc1P19123 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnnc1P19123 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnnc1P19123 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnnc1P19123 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnnc1P19123 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnnc1P19123 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnnc1P19123 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnnc1P19123 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnnc1P19123 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnnc1P19123 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnnc1P19123 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnnc1P19123 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnnc1P19123 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnnc1P19123 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnnc1P19123 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnnc1P19123 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnnc1P19123 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnnc1P19123 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnnc1P19123 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnnc1P19123 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnnc1P19123 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnnc1P19123 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnnc1P19123 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnnc1P19123 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnnc1P19123 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnnc1P19123 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnnc1P19123 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnnc1P19123 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnnc1P19123 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnnc1P19123 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnnc1P19123 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms