Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

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Length 829 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtpraP18052 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtpraP18052 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PtpraP18052 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtpraP18052 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PtpraP18052 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtpraP18052 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtpraP18052 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtpraP18052 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtpraP18052 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtpraP18052 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtpraP18052 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtpraP18052 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtpraP18052 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtpraP18052 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtpraP18052 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtpraP18052 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtpraP18052 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtpraP18052 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtpraP18052 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PtpraP18052 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PtpraP18052 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PtpraP18052 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PtpraP18052 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PtpraP18052 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PtpraP18052 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PtpraP18052 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PtpraP18052 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PtpraP18052 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PtpraP18052 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PtpraP18052 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PtpraP18052 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PtpraP18052 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PtpraP18052 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PtpraP18052 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PtpraP18052 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PtpraP18052 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PtpraP18052 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PtpraP18052 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PtpraP18052 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PtpraP18052 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PtpraP18052 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PtpraP18052 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PtpraP18052 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PtpraP18052 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PtpraP18052 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PtpraP18052 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PtpraP18052 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PtpraP18052 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PtpraP18052 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PtpraP18052 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PtpraP18052 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PtpraP18052 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PtpraP18052 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PtpraP18052 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PtpraP18052 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PtpraP18052 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PtpraP18052 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PtpraP18052 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PtpraP18052 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PtpraP18052 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PtpraP18052 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PtpraP18052 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PtpraP18052 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PtpraP18052 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PtpraP18052 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PtpraP18052 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PtpraP18052 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PtpraP18052 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PtpraP18052 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PtpraP18052 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PtpraP18052 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PtpraP18052 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PtpraP18052 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PtpraP18052 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PtpraP18052 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PtpraP18052 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PtpraP18052 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PtpraP18052 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PtpraP18052 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PtpraP18052 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PtpraP18052 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PtpraP18052 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PtpraP18052 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PtpraP18052 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PtpraP18052 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PtpraP18052 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PtpraP18052 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PtpraP18052 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PtpraP18052 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PtpraP18052 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PtpraP18052 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PtpraP18052 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PtpraP18052 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PtpraP18052 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PtpraP18052 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PtpraP18052 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PtpraP18052 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PtpraP18052 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PtpraP18052 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms