Protein–RNA interactions for Protein: P0DP28

Calm3, Calmodulin-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calm3P0DP28 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Calm3P0DP28 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Calm3P0DP28 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Calm3P0DP28 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Calm3P0DP28 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Calm3P0DP28 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Calm3P0DP28 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Calm3P0DP28 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Calm3P0DP28 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Calm3P0DP28 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Calm3P0DP28 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Calm3P0DP28 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Calm3P0DP28 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Calm3P0DP28 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Calm3P0DP28 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Calm3P0DP28 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Calm3P0DP28 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Calm3P0DP28 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Calm3P0DP28 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Calm3P0DP28 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Calm3P0DP28 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Calm3P0DP28 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Calm3P0DP28 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Calm3P0DP28 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Calm3P0DP28 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Calm3P0DP28 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Calm3P0DP28 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Calm3P0DP28 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Calm3P0DP28 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Calm3P0DP28 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Calm3P0DP28 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Calm3P0DP28 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Calm3P0DP28 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Calm3P0DP28 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Calm3P0DP28 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Calm3P0DP28 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Calm3P0DP28 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Calm3P0DP28 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Calm3P0DP28 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Calm3P0DP28 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Calm3P0DP28 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Calm3P0DP28 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Calm3P0DP28 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Calm3P0DP28 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Calm3P0DP28 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Calm3P0DP28 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Calm3P0DP28 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Calm3P0DP28 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Calm3P0DP28 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Calm3P0DP28 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Calm3P0DP28 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Calm3P0DP28 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Calm3P0DP28 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Calm3P0DP28 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Calm3P0DP28 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Calm3P0DP28 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Calm3P0DP28 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Calm3P0DP28 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Calm3P0DP28 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Calm3P0DP28 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Calm3P0DP28 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Calm3P0DP28 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Calm3P0DP28 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Calm3P0DP28 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Calm3P0DP28 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Calm3P0DP28 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Calm3P0DP28 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Calm3P0DP28 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Calm3P0DP28 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Calm3P0DP28 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Calm3P0DP28 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Calm3P0DP28 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Calm3P0DP28 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Calm3P0DP28 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Calm3P0DP28 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Calm3P0DP28 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Calm3P0DP28 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Calm3P0DP28 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Calm3P0DP28 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Calm3P0DP28 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Calm3P0DP28 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Calm3P0DP28 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Calm3P0DP28 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Calm3P0DP28 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Calm3P0DP28 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Calm3P0DP28 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Calm3P0DP28 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Calm3P0DP28 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Calm3P0DP28 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Calm3P0DP28 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Calm3P0DP28 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Calm3P0DP28 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Calm3P0DP28 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Calm3P0DP28 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Calm3P0DP28 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Calm3P0DP28 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Calm3P0DP28 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Calm3P0DP28 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Calm3P0DP28 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Calm3P0DP28 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.1 ms