Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
H2-Eb1P04230 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
H2-Eb1P04230 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
H2-Eb1P04230 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
H2-Eb1P04230 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
H2-Eb1P04230 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
H2-Eb1P04230 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
H2-Eb1P04230 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
H2-Eb1P04230 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
H2-Eb1P04230 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
H2-Eb1P04230 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
H2-Eb1P04230 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
H2-Eb1P04230 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
H2-Eb1P04230 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
H2-Eb1P04230 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
H2-Eb1P04230 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
H2-Eb1P04230 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
H2-Eb1P04230 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
H2-Eb1P04230 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
H2-Eb1P04230 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
H2-Eb1P04230 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
H2-Eb1P04230 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
H2-Eb1P04230 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
H2-Eb1P04230 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
H2-Eb1P04230 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
H2-Eb1P04230 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
H2-Eb1P04230 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
H2-Eb1P04230 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
H2-Eb1P04230 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
H2-Eb1P04230 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
H2-Eb1P04230 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
H2-Eb1P04230 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
H2-Eb1P04230 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
H2-Eb1P04230 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
H2-Eb1P04230 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
H2-Eb1P04230 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
H2-Eb1P04230 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
H2-Eb1P04230 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
H2-Eb1P04230 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
H2-Eb1P04230 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
H2-Eb1P04230 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
H2-Eb1P04230 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
H2-Eb1P04230 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
H2-Eb1P04230 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
H2-Eb1P04230 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
H2-Eb1P04230 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
H2-Eb1P04230 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
H2-Eb1P04230 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
H2-Eb1P04230 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
H2-Eb1P04230 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
H2-Eb1P04230 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
H2-Eb1P04230 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
H2-Eb1P04230 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
H2-Eb1P04230 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
H2-Eb1P04230 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
H2-Eb1P04230 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
H2-Eb1P04230 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
H2-Eb1P04230 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
H2-Eb1P04230 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
H2-Eb1P04230 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
H2-Eb1P04230 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
H2-Eb1P04230 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
H2-Eb1P04230 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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H2-Eb1P04230 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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H2-Eb1P04230 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
H2-Eb1P04230 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
H2-Eb1P04230 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
H2-Eb1P04230 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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H2-Eb1P04230 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
H2-Eb1P04230 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
H2-Eb1P04230 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
H2-Eb1P04230 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
H2-Eb1P04230 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
H2-Eb1P04230 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
H2-Eb1P04230 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
H2-Eb1P04230 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
H2-Eb1P04230 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
H2-Eb1P04230 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC13.9□□□□□ -0.19
H2-Eb1P04230 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
H2-Eb1P04230 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
H2-Eb1P04230 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
H2-Eb1P04230 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
H2-Eb1P04230 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
H2-Eb1P04230 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
H2-Eb1P04230 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
H2-Eb1P04230 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
H2-Eb1P04230 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
H2-Eb1P04230 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
H2-Eb1P04230 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
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H2-Eb1P04230 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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