Protein–RNA interactions for Protein: P01660

Ig kappa chain V-III region PC 3741/TEPC 111, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01660 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01660 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01660 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01660 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
P01660 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01660 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01660 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01660 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01660 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01660 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01660 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P01660 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01660 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01660 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01660 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01660 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01660 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01660 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01660 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01660 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01660 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01660 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01660 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P01660 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P01660 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P01660 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P01660 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P01660 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P01660 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P01660 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P01660 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P01660 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01660 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01660 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P01660 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P01660 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P01660 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P01660 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P01660 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P01660 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P01660 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P01660 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P01660 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P01660 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P01660 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P01660 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P01660 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P01660 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P01660 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P01660 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P01660 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P01660 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P01660 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P01660 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P01660 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P01660 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P01660 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P01660 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01660 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01660 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01660 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01660 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P01660 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01660 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01660 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01660 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01660 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01660 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01660 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01660 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P01660 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01660 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01660 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01660 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01660 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01660 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01660 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01660 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01660 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01660 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01660 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01660 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01660 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01660 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01660 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
P01660 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01660 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01660 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01660 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01660 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01660 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01660 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01660 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01660 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01660 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01660 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
P01660 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01660 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01660 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01660 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms