Protein–RNA interactions for Protein: O88554

Parp2, Poly [ADP-ribose] polymerase 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp2O88554 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Parp2O88554 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Parp2O88554 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Parp2O88554 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Parp2O88554 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Parp2O88554 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Parp2O88554 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Parp2O88554 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Parp2O88554 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Parp2O88554 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Parp2O88554 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Parp2O88554 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Parp2O88554 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Parp2O88554 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Parp2O88554 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Parp2O88554 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Parp2O88554 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Parp2O88554 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Parp2O88554 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Parp2O88554 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Parp2O88554 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Parp2O88554 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Parp2O88554 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Parp2O88554 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Parp2O88554 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Parp2O88554 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Parp2O88554 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Parp2O88554 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Parp2O88554 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Parp2O88554 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Parp2O88554 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Parp2O88554 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Parp2O88554 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Parp2O88554 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Parp2O88554 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Parp2O88554 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Parp2O88554 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Parp2O88554 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Parp2O88554 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Parp2O88554 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Parp2O88554 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Parp2O88554 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Parp2O88554 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Parp2O88554 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Parp2O88554 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Parp2O88554 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Parp2O88554 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Parp2O88554 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Parp2O88554 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Parp2O88554 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Parp2O88554 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Parp2O88554 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Parp2O88554 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Parp2O88554 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Parp2O88554 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Parp2O88554 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Parp2O88554 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Parp2O88554 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Parp2O88554 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Parp2O88554 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Parp2O88554 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Parp2O88554 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Parp2O88554 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Parp2O88554 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Parp2O88554 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Parp2O88554 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Parp2O88554 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Parp2O88554 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Parp2O88554 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Parp2O88554 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Parp2O88554 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Parp2O88554 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Parp2O88554 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Parp2O88554 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Parp2O88554 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Parp2O88554 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Parp2O88554 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Parp2O88554 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Parp2O88554 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Parp2O88554 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Parp2O88554 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Parp2O88554 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Parp2O88554 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Parp2O88554 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Parp2O88554 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Parp2O88554 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Parp2O88554 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Parp2O88554 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Parp2O88554 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Parp2O88554 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Parp2O88554 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Parp2O88554 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Parp2O88554 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Parp2O88554 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Parp2O88554 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Parp2O88554 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Parp2O88554 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Parp2O88554 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Parp2O88554 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Parp2O88554 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms