Protein–RNA interactions for Protein: O55029

Copb2, Coatomer subunit beta', mousemouse

Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb2O55029 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Copb2O55029 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Copb2O55029 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Copb2O55029 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Copb2O55029 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Copb2O55029 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Copb2O55029 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Copb2O55029 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Copb2O55029 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Copb2O55029 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Copb2O55029 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Copb2O55029 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Copb2O55029 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Copb2O55029 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Copb2O55029 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Copb2O55029 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Copb2O55029 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Copb2O55029 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Copb2O55029 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Copb2O55029 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Copb2O55029 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Copb2O55029 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Copb2O55029 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Copb2O55029 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Copb2O55029 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Copb2O55029 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Copb2O55029 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Copb2O55029 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Copb2O55029 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Copb2O55029 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Copb2O55029 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Copb2O55029 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Copb2O55029 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Copb2O55029 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Copb2O55029 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Copb2O55029 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Copb2O55029 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Copb2O55029 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Copb2O55029 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Copb2O55029 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Copb2O55029 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Copb2O55029 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Copb2O55029 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Copb2O55029 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Copb2O55029 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Copb2O55029 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Copb2O55029 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Copb2O55029 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Copb2O55029 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Copb2O55029 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Copb2O55029 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Copb2O55029 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Copb2O55029 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Copb2O55029 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Copb2O55029 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Copb2O55029 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Copb2O55029 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Copb2O55029 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Copb2O55029 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Copb2O55029 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Copb2O55029 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Copb2O55029 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Copb2O55029 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Copb2O55029 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Copb2O55029 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Copb2O55029 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Copb2O55029 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Copb2O55029 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Copb2O55029 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Copb2O55029 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Copb2O55029 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Copb2O55029 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Copb2O55029 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Copb2O55029 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Copb2O55029 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Copb2O55029 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Copb2O55029 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Copb2O55029 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Copb2O55029 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Copb2O55029 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Copb2O55029 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Copb2O55029 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Copb2O55029 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Copb2O55029 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Copb2O55029 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Copb2O55029 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Copb2O55029 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Copb2O55029 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Copb2O55029 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Copb2O55029 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Copb2O55029 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Copb2O55029 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Copb2O55029 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Copb2O55029 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Copb2O55029 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Copb2O55029 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Copb2O55029 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Copb2O55029 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Copb2O55029 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Copb2O55029 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms