Protein–RNA interactions for Protein: O09044

Snap23, Synaptosomal-associated protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap23O09044 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Snap23O09044 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snap23O09044 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snap23O09044 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snap23O09044 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snap23O09044 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snap23O09044 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snap23O09044 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snap23O09044 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snap23O09044 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snap23O09044 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snap23O09044 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snap23O09044 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snap23O09044 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snap23O09044 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snap23O09044 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snap23O09044 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snap23O09044 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Snap23O09044 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snap23O09044 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snap23O09044 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snap23O09044 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snap23O09044 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snap23O09044 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snap23O09044 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snap23O09044 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Snap23O09044 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snap23O09044 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snap23O09044 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snap23O09044 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snap23O09044 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snap23O09044 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snap23O09044 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snap23O09044 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snap23O09044 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snap23O09044 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snap23O09044 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Snap23O09044 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Snap23O09044 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snap23O09044 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Snap23O09044 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snap23O09044 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snap23O09044 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snap23O09044 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snap23O09044 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snap23O09044 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snap23O09044 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snap23O09044 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snap23O09044 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snap23O09044 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snap23O09044 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snap23O09044 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Snap23O09044 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snap23O09044 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snap23O09044 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snap23O09044 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Snap23O09044 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snap23O09044 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Snap23O09044 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Snap23O09044 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snap23O09044 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snap23O09044 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snap23O09044 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snap23O09044 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snap23O09044 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snap23O09044 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snap23O09044 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snap23O09044 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snap23O09044 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snap23O09044 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snap23O09044 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snap23O09044 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snap23O09044 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snap23O09044 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snap23O09044 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snap23O09044 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snap23O09044 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Snap23O09044 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Snap23O09044 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snap23O09044 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snap23O09044 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snap23O09044 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snap23O09044 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snap23O09044 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snap23O09044 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Snap23O09044 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snap23O09044 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Snap23O09044 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snap23O09044 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snap23O09044 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snap23O09044 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snap23O09044 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Snap23O09044 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Snap23O09044 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Snap23O09044 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snap23O09044 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snap23O09044 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snap23O09044 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snap23O09044 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snap23O09044 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.9 ms