Protein–RNA interactions for Protein: O08917

Flot1, Flotillin-1, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Flot1O08917 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Flot1O08917 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Flot1O08917 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Flot1O08917 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Flot1O08917 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Flot1O08917 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Flot1O08917 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Flot1O08917 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Flot1O08917 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Flot1O08917 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Flot1O08917 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Flot1O08917 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Flot1O08917 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Flot1O08917 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Flot1O08917 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Flot1O08917 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Flot1O08917 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Flot1O08917 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Flot1O08917 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Flot1O08917 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Flot1O08917 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Flot1O08917 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Flot1O08917 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Flot1O08917 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Flot1O08917 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Flot1O08917 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Flot1O08917 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Flot1O08917 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Flot1O08917 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Flot1O08917 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Flot1O08917 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Flot1O08917 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Flot1O08917 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Flot1O08917 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Flot1O08917 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Flot1O08917 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Flot1O08917 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Flot1O08917 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Flot1O08917 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Flot1O08917 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Flot1O08917 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Flot1O08917 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Flot1O08917 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Flot1O08917 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Flot1O08917 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Flot1O08917 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Flot1O08917 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Flot1O08917 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Flot1O08917 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Flot1O08917 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Flot1O08917 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Flot1O08917 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Flot1O08917 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Flot1O08917 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Flot1O08917 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Flot1O08917 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Flot1O08917 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Flot1O08917 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Flot1O08917 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Flot1O08917 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Flot1O08917 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Flot1O08917 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Flot1O08917 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Flot1O08917 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Flot1O08917 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Flot1O08917 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Flot1O08917 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Flot1O08917 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Flot1O08917 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Flot1O08917 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Flot1O08917 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Flot1O08917 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Flot1O08917 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Flot1O08917 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Flot1O08917 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Flot1O08917 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Flot1O08917 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Flot1O08917 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Flot1O08917 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Flot1O08917 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Flot1O08917 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Flot1O08917 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Flot1O08917 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Flot1O08917 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Flot1O08917 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Flot1O08917 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Flot1O08917 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Flot1O08917 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Flot1O08917 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Flot1O08917 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Flot1O08917 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Flot1O08917 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Flot1O08917 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Flot1O08917 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Flot1O08917 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Flot1O08917 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Flot1O08917 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Flot1O08917 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Flot1O08917 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Flot1O08917 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.7 ms