Protein–RNA interactions for Protein: J3QPE5

Gm5849, Predicted gene 5849, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5849J3QPE5 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm5849J3QPE5 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm5849J3QPE5 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm5849J3QPE5 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm5849J3QPE5 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm5849J3QPE5 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5849J3QPE5 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5849J3QPE5 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5849J3QPE5 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5849J3QPE5 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5849J3QPE5 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5849J3QPE5 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5849J3QPE5 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5849J3QPE5 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5849J3QPE5 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5849J3QPE5 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5849J3QPE5 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5849J3QPE5 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5849J3QPE5 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5849J3QPE5 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5849J3QPE5 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5849J3QPE5 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5849J3QPE5 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5849J3QPE5 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5849J3QPE5 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5849J3QPE5 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5849J3QPE5 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5849J3QPE5 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5849J3QPE5 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5849J3QPE5 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5849J3QPE5 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5849J3QPE5 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5849J3QPE5 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5849J3QPE5 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5849J3QPE5 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5849J3QPE5 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5849J3QPE5 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5849J3QPE5 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5849J3QPE5 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5849J3QPE5 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5849J3QPE5 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5849J3QPE5 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5849J3QPE5 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5849J3QPE5 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5849J3QPE5 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5849J3QPE5 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5849J3QPE5 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5849J3QPE5 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5849J3QPE5 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5849J3QPE5 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5849J3QPE5 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5849J3QPE5 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5849J3QPE5 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5849J3QPE5 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5849J3QPE5 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5849J3QPE5 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5849J3QPE5 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5849J3QPE5 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5849J3QPE5 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5849J3QPE5 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5849J3QPE5 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5849J3QPE5 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5849J3QPE5 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5849J3QPE5 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5849J3QPE5 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5849J3QPE5 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5849J3QPE5 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5849J3QPE5 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5849J3QPE5 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5849J3QPE5 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5849J3QPE5 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5849J3QPE5 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5849J3QPE5 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5849J3QPE5 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5849J3QPE5 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5849J3QPE5 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5849J3QPE5 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5849J3QPE5 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5849J3QPE5 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5849J3QPE5 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5849J3QPE5 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5849J3QPE5 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5849J3QPE5 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5849J3QPE5 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5849J3QPE5 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5849J3QPE5 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5849J3QPE5 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5849J3QPE5 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5849J3QPE5 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5849J3QPE5 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5849J3QPE5 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5849J3QPE5 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5849J3QPE5 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5849J3QPE5 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5849J3QPE5 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5849J3QPE5 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5849J3QPE5 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5849J3QPE5 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5849J3QPE5 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5849J3QPE5 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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