Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 AC153961.1-201ENSMUST00000217760 385 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms