Protein–RNA interactions for Protein: G3X9K3

Arfgef1, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef1G3X9K3 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Arfgef1G3X9K3 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Arfgef1G3X9K3 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arfgef1G3X9K3 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arfgef1G3X9K3 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arfgef1G3X9K3 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arfgef1G3X9K3 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arfgef1G3X9K3 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arfgef1G3X9K3 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arfgef1G3X9K3 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arfgef1G3X9K3 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arfgef1G3X9K3 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arfgef1G3X9K3 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arfgef1G3X9K3 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arfgef1G3X9K3 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arfgef1G3X9K3 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arfgef1G3X9K3 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arfgef1G3X9K3 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arfgef1G3X9K3 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Arfgef1G3X9K3 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arfgef1G3X9K3 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arfgef1G3X9K3 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arfgef1G3X9K3 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arfgef1G3X9K3 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arfgef1G3X9K3 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arfgef1G3X9K3 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arfgef1G3X9K3 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arfgef1G3X9K3 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Arfgef1G3X9K3 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arfgef1G3X9K3 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arfgef1G3X9K3 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arfgef1G3X9K3 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arfgef1G3X9K3 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arfgef1G3X9K3 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arfgef1G3X9K3 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arfgef1G3X9K3 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arfgef1G3X9K3 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arfgef1G3X9K3 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arfgef1G3X9K3 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arfgef1G3X9K3 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arfgef1G3X9K3 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arfgef1G3X9K3 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arfgef1G3X9K3 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arfgef1G3X9K3 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arfgef1G3X9K3 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arfgef1G3X9K3 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arfgef1G3X9K3 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arfgef1G3X9K3 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arfgef1G3X9K3 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arfgef1G3X9K3 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Arfgef1G3X9K3 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arfgef1G3X9K3 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arfgef1G3X9K3 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arfgef1G3X9K3 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Arfgef1G3X9K3 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arfgef1G3X9K3 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arfgef1G3X9K3 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arfgef1G3X9K3 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Arfgef1G3X9K3 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Arfgef1G3X9K3 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arfgef1G3X9K3 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Arfgef1G3X9K3 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arfgef1G3X9K3 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arfgef1G3X9K3 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arfgef1G3X9K3 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arfgef1G3X9K3 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arfgef1G3X9K3 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arfgef1G3X9K3 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arfgef1G3X9K3 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arfgef1G3X9K3 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arfgef1G3X9K3 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arfgef1G3X9K3 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arfgef1G3X9K3 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arfgef1G3X9K3 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arfgef1G3X9K3 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Arfgef1G3X9K3 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arfgef1G3X9K3 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arfgef1G3X9K3 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arfgef1G3X9K3 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arfgef1G3X9K3 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arfgef1G3X9K3 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arfgef1G3X9K3 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Arfgef1G3X9K3 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Arfgef1G3X9K3 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Arfgef1G3X9K3 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Arfgef1G3X9K3 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arfgef1G3X9K3 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Arfgef1G3X9K3 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arfgef1G3X9K3 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arfgef1G3X9K3 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arfgef1G3X9K3 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arfgef1G3X9K3 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arfgef1G3X9K3 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arfgef1G3X9K3 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arfgef1G3X9K3 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arfgef1G3X9K3 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arfgef1G3X9K3 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arfgef1G3X9K3 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arfgef1G3X9K3 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arfgef1G3X9K3 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.7 ms