Protein–RNA interactions for Protein: F8VPX6

Speer4a, Spermatogenesis-associated glutamate (E)-rich protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4aF8VPX6 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Speer4aF8VPX6 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Speer4aF8VPX6 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Speer4aF8VPX6 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Speer4aF8VPX6 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Speer4aF8VPX6 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Speer4aF8VPX6 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Speer4aF8VPX6 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Speer4aF8VPX6 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Speer4aF8VPX6 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Speer4aF8VPX6 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Speer4aF8VPX6 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Speer4aF8VPX6 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Speer4aF8VPX6 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Speer4aF8VPX6 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Speer4aF8VPX6 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Speer4aF8VPX6 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Speer4aF8VPX6 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Speer4aF8VPX6 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Speer4aF8VPX6 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Speer4aF8VPX6 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Speer4aF8VPX6 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Speer4aF8VPX6 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Speer4aF8VPX6 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Speer4aF8VPX6 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Speer4aF8VPX6 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Speer4aF8VPX6 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Speer4aF8VPX6 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Speer4aF8VPX6 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Speer4aF8VPX6 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Speer4aF8VPX6 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Speer4aF8VPX6 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Speer4aF8VPX6 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Speer4aF8VPX6 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Speer4aF8VPX6 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Speer4aF8VPX6 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Speer4aF8VPX6 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Speer4aF8VPX6 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Speer4aF8VPX6 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Speer4aF8VPX6 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Speer4aF8VPX6 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Speer4aF8VPX6 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Speer4aF8VPX6 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Speer4aF8VPX6 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Speer4aF8VPX6 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Speer4aF8VPX6 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Speer4aF8VPX6 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Speer4aF8VPX6 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Speer4aF8VPX6 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Speer4aF8VPX6 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Speer4aF8VPX6 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Speer4aF8VPX6 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Speer4aF8VPX6 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Speer4aF8VPX6 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Speer4aF8VPX6 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Speer4aF8VPX6 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Speer4aF8VPX6 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Speer4aF8VPX6 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Speer4aF8VPX6 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Speer4aF8VPX6 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Speer4aF8VPX6 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Speer4aF8VPX6 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Speer4aF8VPX6 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Speer4aF8VPX6 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Speer4aF8VPX6 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Speer4aF8VPX6 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Speer4aF8VPX6 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Speer4aF8VPX6 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Speer4aF8VPX6 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Speer4aF8VPX6 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Speer4aF8VPX6 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Speer4aF8VPX6 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Speer4aF8VPX6 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Speer4aF8VPX6 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Speer4aF8VPX6 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Speer4aF8VPX6 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Speer4aF8VPX6 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Speer4aF8VPX6 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Speer4aF8VPX6 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Speer4aF8VPX6 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Speer4aF8VPX6 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Speer4aF8VPX6 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Speer4aF8VPX6 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Speer4aF8VPX6 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Speer4aF8VPX6 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Speer4aF8VPX6 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Speer4aF8VPX6 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Speer4aF8VPX6 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Speer4aF8VPX6 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Speer4aF8VPX6 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Speer4aF8VPX6 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Speer4aF8VPX6 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Speer4aF8VPX6 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Speer4aF8VPX6 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Speer4aF8VPX6 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Speer4aF8VPX6 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Speer4aF8VPX6 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Speer4aF8VPX6 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Speer4aF8VPX6 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Speer4aF8VPX6 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms