Protein–RNA interactions for Protein: F6SEU4

Syngap1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngap1F6SEU4 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syngap1F6SEU4 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syngap1F6SEU4 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syngap1F6SEU4 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syngap1F6SEU4 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syngap1F6SEU4 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syngap1F6SEU4 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syngap1F6SEU4 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syngap1F6SEU4 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syngap1F6SEU4 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syngap1F6SEU4 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syngap1F6SEU4 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syngap1F6SEU4 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syngap1F6SEU4 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syngap1F6SEU4 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syngap1F6SEU4 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syngap1F6SEU4 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syngap1F6SEU4 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syngap1F6SEU4 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syngap1F6SEU4 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syngap1F6SEU4 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syngap1F6SEU4 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syngap1F6SEU4 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syngap1F6SEU4 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syngap1F6SEU4 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syngap1F6SEU4 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syngap1F6SEU4 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syngap1F6SEU4 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syngap1F6SEU4 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syngap1F6SEU4 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syngap1F6SEU4 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syngap1F6SEU4 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Syngap1F6SEU4 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syngap1F6SEU4 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Syngap1F6SEU4 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Syngap1F6SEU4 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syngap1F6SEU4 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syngap1F6SEU4 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syngap1F6SEU4 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syngap1F6SEU4 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Syngap1F6SEU4 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syngap1F6SEU4 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syngap1F6SEU4 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syngap1F6SEU4 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syngap1F6SEU4 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syngap1F6SEU4 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syngap1F6SEU4 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syngap1F6SEU4 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syngap1F6SEU4 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syngap1F6SEU4 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syngap1F6SEU4 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syngap1F6SEU4 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syngap1F6SEU4 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syngap1F6SEU4 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syngap1F6SEU4 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syngap1F6SEU4 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syngap1F6SEU4 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syngap1F6SEU4 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syngap1F6SEU4 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Syngap1F6SEU4 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syngap1F6SEU4 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syngap1F6SEU4 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syngap1F6SEU4 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Syngap1F6SEU4 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Syngap1F6SEU4 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Syngap1F6SEU4 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syngap1F6SEU4 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Syngap1F6SEU4 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syngap1F6SEU4 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syngap1F6SEU4 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syngap1F6SEU4 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syngap1F6SEU4 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syngap1F6SEU4 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Syngap1F6SEU4 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syngap1F6SEU4 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syngap1F6SEU4 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syngap1F6SEU4 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syngap1F6SEU4 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Syngap1F6SEU4 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syngap1F6SEU4 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syngap1F6SEU4 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syngap1F6SEU4 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syngap1F6SEU4 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Syngap1F6SEU4 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syngap1F6SEU4 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syngap1F6SEU4 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syngap1F6SEU4 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syngap1F6SEU4 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syngap1F6SEU4 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syngap1F6SEU4 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syngap1F6SEU4 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syngap1F6SEU4 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Syngap1F6SEU4 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Syngap1F6SEU4 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Syngap1F6SEU4 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Syngap1F6SEU4 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Syngap1F6SEU4 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Syngap1F6SEU4 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Syngap1F6SEU4 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Syngap1F6SEU4 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms