Protein–RNA interactions for Protein: F6RGI3

Gm340, Predicted gene 340, mousemouse

Predictions only

Length 1,242 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm340F6RGI3 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
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